2. workshop ZP Doprava se konal 28. června 2013 na Krajském úřadu Jihočeského kraje v Českých Budějovicích. Zúčastnilo se ho 21 expertů a několik hostů ze všech regionů ERDV. Účastníci akce byli informováni o dění v ERDV vč. aktivit v oblasti dopravy a o plnění závěrů 1. workshopu. Poté se diskutovalo o formách prezentace činnosti ZP navenek, které byly následně postupně realizovány. V rámci rozvoje expertní informační sítě byly pre-zentovány vyvinuté originální výše zmíněné databáze naplněné údaji od expertů ZP.
Byl projednán rovněž návrh metodiky a harmonogramu multikriteriálního hodnocení projektových námětů, jakož i hodnoticí formulář navržený také jihočeskými experty. Byl také představen první seznam 32 námětů dopravních projektů ze všech regionů ERDV. Při cenných odborných diskusích zaznělo 37 příspěvků od hostů a 13 expertů ze všech zemí. Regiony obdržely řadu úkolů souvisejících zejména s prezentací jednotlivých projektů na příštím jednání. Navazující oslavy 1. výročí založení ERDV u Vltavy se zúčastnilo 8 expertů. Celý průběh workshopu byl dokumentován v obsáhlém protokolu s 12 přílohami.
K významným projektovým inovacím, vzešlým z 2. workshopu, patří zejména rozpracování metodiky kvalitativního multikriteriálního hodnocení podaných projektových námětů, bilaterální dohody mezi regiony u společných přeshraničních dopravních os (zrcadlové projekty), plánované uspořádání malého trilaterálního workshopu v září 2013 zaměřeného na komparaci dopravních procesů v oblasti infrastrukturních staveb či vytvoření přehledové mapy ERDV se zakreslenými navrženými infrastrukturními i neinfrastrukturními projektovými náměty.